More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1049 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  449  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1652  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 196 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 183 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 201 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3293  regulatory protein TetR  35.79 
 
 		 208 aa  90.9  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147599  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  45.67 
 
 		 188 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13072  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 204 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.483288 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  52 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2774  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0349028  normal  0.98242 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4309  TetR family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2038  TetR family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 208 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34410  transcriptional regulator  40 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.633613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4774  transcriptional regulator, TetR family  53.19 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0197844  hitchhiker  0.000543093 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  51.16 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  38.66 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  64.91 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3809  transcriptional regulator, TetR family  46.75 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0721  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  43.97 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6821  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  46.91 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  47.76 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  50.57 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  46.48 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  48 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  40.57 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  56.9 
 
 		 266 aa  65.1  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  41.04 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  48.53 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 193 aa  65.1  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  48.75 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  52.24 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  53.73 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1216  transcriptional regulator, TetR family  40.34 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187428 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2600  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  47.56 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2654  regulatory protein TetR  51.72 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1571  transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.538568  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0767  transcriptional regulator, TetR family  46.74 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.504408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  55.07 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  44.94 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  48.1 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  62.5 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5465  putative transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0907428 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4018  TetR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3680  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 245 aa  62  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 190 aa  62  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  43.68 
 
 		 197 aa  62  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 184 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  44.09 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  48.53 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  38.78 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  43.02 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  45.59 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  46.51 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27910  transcriptional regulator, tetR family  48.72 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.794272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1813  TetR family transcriptional regulator  57.75 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  43.59 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1860  TetR family transcriptional regulator  57.75 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.237436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1794  TetR family transcriptional regulator  57.75 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0486458  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  58.62 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  38.3 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  43.9 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  47 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  34.69 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  46.38 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1442  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 167 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2615  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  42.17 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>