195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0387 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  100 
 
 		 211 aa  417  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  47.03 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2829  regulatory protein TetR  48.35 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  40.64 
 
 		 189 aa  121  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 209 aa  105  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  43.24 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 193 aa  98.6  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 193 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 174 aa  95.1  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  34.64 
 
 		 174 aa  94.7  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 194 aa  93.6  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 188 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 198 aa  90.5  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 199 aa  88.6  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 194 aa  85.9  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 192 aa  85.1  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 186 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  35.26 
 
 		 190 aa  84.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 184 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  36.77 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  34.04 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 250 aa  78.2  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  33.15 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  32.04 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  33.94 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  39.61 
 
 		 195 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  37.09 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 211 aa  72  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 236 aa  71.6  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  36.69 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 176 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0982  regulatory protein TetR  33.88 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  31.15 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  36.88 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  36.48 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 299 aa  65.1  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 245 aa  64.7  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  34.42 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 193 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1574  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  40.82 
 
 		 223 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1551  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1574  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>