More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2186 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 237 aa  470  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  48.51 
 
 		 218 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1510  transcriptional regulator, TetR family  53.41 
 
 		 240 aa  158  7e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116924  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  44.61 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1559  transcriptional regulator, TetR family  46.93 
 
 		 221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  40.66 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  41.36 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 217 aa  121  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  38.74 
 
 		 245 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  39.67 
 
 		 213 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 213 aa  115  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  39.49 
 
 		 220 aa  115  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  39.49 
 
 		 199 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  41.5 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5106  putative transcriptional regulator, TetR family  44.72 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586714 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 188 aa  108  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  40.2 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 227 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 223 aa  106  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  37.85 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 205 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 206 aa  98.6  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27910  transcriptional regulator, tetR family  42.39 
 
 		 194 aa  98.6  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.794272 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  41.56 
 
 		 189 aa  95.5  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 299 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  92.4  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 207 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 197 aa  89  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 192 aa  87.8  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 184 aa  87.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  38.42 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2057  putative transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334012  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 186 aa  86.3  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5248  putative transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 227 aa  85.5  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 203 aa  85.1  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  67.19 
 
 		 190 aa  85.1  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  32.43 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4496  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4583  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4879  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  37.99 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  35.91 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  37.44 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0877  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  34.24 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 174 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5834  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 188 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  31.91 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  33.7 
 
 		 174 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0927  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.468026  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8897  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  35.87 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  38.8 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0331  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2371  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0164383  normal  0.061065 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10067  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.504189 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  34.22 
 
 		 182 aa  74.7  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1492  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  31.75 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04693  transcriptional regulator TetR/acrR family  36 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0767  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.504408  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 193 aa  72  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2786  regulatory protein TetR  33.16 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 189 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  43 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  57.58 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02120  transcriptional regulator, tetR family  38.12 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.19222  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  31.84 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>