More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2539 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  433  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2615  transcriptional regulator, TetR family  44.06 
 
 		 216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  37.56 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  39.59 
 
 		 202 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1788  transcriptional regulator, TetR family  41.08 
 
 		 194 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2786  regulatory protein TetR  36.68 
 
 		 243 aa  98.6  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 196 aa  97.1  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 173 aa  96.3  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 266 aa  95.1  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  38.19 
 
 		 299 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  35.75 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 199 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  37.24 
 
 		 219 aa  92.4  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 206 aa  92  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  38.12 
 
 		 190 aa  89.7  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 223 aa  89  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  31.53 
 
 		 218 aa  88.6  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 184 aa  88.6  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 188 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  37.09 
 
 		 192 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  39.27 
 
 		 203 aa  85.5  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 213 aa  85.1  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8897  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 222 aa  85.1  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 192 aa  85.1  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 216 aa  85.1  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 250 aa  85.1  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3935  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00534901 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  36.06 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  32.23 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  35.6 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0331  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  32.83 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  36.48 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  31.75 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  34.2 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  38.22 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 259 aa  75.1  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1559  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27910  transcriptional regulator, tetR family  35.86 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.794272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 193 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0927  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.468026  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  38.12 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 210 aa  72  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  32.98 
 
 		 174 aa  72  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4496  TetR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4583  TetR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 189 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_4879  TetR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  32.83 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
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NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
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NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  31.94 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  34.01 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
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NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  46.59 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 193 aa  68.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
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NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
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NC_009565  TBFG_10067  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.504189 
 
 
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NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
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