More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8965 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 173 aa  343  8e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  62.79 
 
 		 195 aa  207  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  52.91 
 
 		 179 aa  177  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  40.33 
 
 		 203 aa  95.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  38.19 
 
 		 206 aa  94.7  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 202 aa  94.4  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 188 aa  89.4  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 185 aa  89  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2615  transcriptional regulator, TetR family  39.75 
 
 		 216 aa  87.8  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 193 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 196 aa  85.5  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 236 aa  85.5  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2786  regulatory protein TetR  36.24 
 
 		 243 aa  85.5  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  39.29 
 
 		 223 aa  84.7  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27910  transcriptional regulator, tetR family  37.76 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.794272 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  63.33 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 259 aa  77.8  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 266 aa  77.8  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  35.39 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  64.29 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  51.81 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  32.69 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  32.22 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  46.43 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  64.15 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21000  transcriptional regulator, tetR family  35.53 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  0.198219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1788  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 189 aa  72  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  31.84 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 216 aa  72  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 208 aa  71.2  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 220 aa  71.2  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 227 aa  70.9  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 223 aa  70.9  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3935  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00534901 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 309 aa  68.6  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  35.09 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  35.1 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  33.11 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  31.39 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 227 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02120  transcriptional regulator, tetR family  31.33 
 
 		 194 aa  67  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.19222  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 217 aa  67  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 193 aa  67  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  32.21 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  55 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  56.14 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  30.61 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1559  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21920  transcriptional regulator  35.26 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.048177  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  55 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8897  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 217 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 188 aa  64.3  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 193 aa  64.3  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
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NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_4504  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  32.91 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
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NC_009565  TBFG_10067  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.504189 
 
 
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NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  47.76 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
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