224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0982 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0982  regulatory protein TetR  100 
 
 		 188 aa  360  8e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  42.68 
 
 		 182 aa  97.4  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  39.01 
 
 		 188 aa  88.2  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 193 aa  85.5  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 184 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4496  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4583  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4879  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  37.02 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  46.51 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2444  regulatory protein TetR  39.1 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0957068  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  52.05 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  35.88 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  39.49 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  45.92 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  33.88 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 245 aa  64.7  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2829  regulatory protein TetR  38.38 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  43.82 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5586  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  41.9 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21920  transcriptional regulator  49.21 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.048177  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  42.35 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  39.05 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  30.27 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 266 aa  58.2  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  48.19 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  30.77 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1559  transcriptional regulator, TetR family  35.66 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  40.23 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  46.97 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1492  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  36.47 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1788  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 214 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  32.21 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 236 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4504  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 227 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 230 aa  52.8  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 197 aa  52.4  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  31.21 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2813  regulatory protein TetR  35.94 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  34.11 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  40.86 
 
 		 220 aa  51.6  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>