More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3964 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 174 aa  344  3e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  93.1 
 
 		 174 aa  320  8e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  50.86 
 
 		 193 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  45.25 
 
 		 189 aa  144  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  47.51 
 
 		 202 aa  127  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 201 aa  124  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  44.38 
 
 		 197 aa  123  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  42.29 
 
 		 203 aa  123  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 195 aa  118  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  43.6 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  37.64 
 
 		 209 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 195 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 196 aa  110  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  44.13 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  40.22 
 
 		 199 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  39.05 
 
 		 190 aa  108  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 214 aa  107  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 207 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  37.43 
 
 		 231 aa  107  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  39.2 
 
 		 186 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  42.13 
 
 		 185 aa  105  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  38.86 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  41.42 
 
 		 250 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 184 aa  105  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  36.61 
 
 		 197 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  41.61 
 
 		 192 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 184 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 186 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 201 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  38.33 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  37.22 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 176 aa  99.8  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 211 aa  99.8  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2829  regulatory protein TetR  43.65 
 
 		 203 aa  98.6  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 184 aa  98.2  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 259 aa  97.1  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  42.78 
 
 		 232 aa  97.1  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 211 aa  96.3  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  39.55 
 
 		 181 aa  94.7  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 199 aa  94.7  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  38.56 
 
 		 202 aa  94.4  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 188 aa  93.6  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 208 aa  93.6  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  38.25 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 219 aa  92.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10067  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 189 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.504189 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 198 aa  90.9  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  34.64 
 
 		 211 aa  90.9  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  37.99 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 229 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 189 aa  89  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 184 aa  88.2  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 202 aa  88.2  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 179 aa  87.4  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  50.56 
 
 		 194 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  35.52 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 217 aa  86.3  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 205 aa  85.5  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 186 aa  85.5  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  85.1  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 299 aa  84.7  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  38.36 
 
 		 208 aa  80.9  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  31.61 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  34.1 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 236 aa  78.2  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 192 aa  77.4  0.00000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1551  TetR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1574  TetR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  50 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>