More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2004 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 193 aa  380  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  69.4 
 
 		 193 aa  254  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  67.88 
 
 		 196 aa  249  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  63.74 
 
 		 192 aa  240  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3165  TetR family transcriptional regulator  69.27 
 
 		 195 aa  234  5.0000000000000005e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.871472  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  66.84 
 
 		 195 aa  234  7e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4273  regulatory protein TetR  61.11 
 
 		 190 aa  199  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.532743  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  53.76 
 
 		 207 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  50.56 
 
 		 184 aa  160  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  52.97 
 
 		 202 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2205  transcriptional regulator, TetR family  50.82 
 
 		 196 aa  153  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0927  TetR family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 215 aa  135  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.468026  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  40.86 
 
 		 209 aa  124  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  45.05 
 
 		 186 aa  122  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 192 aa  121  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 196 aa  120  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  36.61 
 
 		 231 aa  111  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2097  TetR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 158 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.530578  normal  0.137365 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 193 aa  108  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 194 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  38.46 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  41.9 
 
 		 196 aa  104  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 189 aa  101  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  39.01 
 
 		 181 aa  99.8  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 195 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 196 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 204 aa  94.4  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 193 aa  92  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 		 186 aa  90.9  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 195 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  37.02 
 
 		 174 aa  90.5  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 211 aa  89.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 174 aa  90.1  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 176 aa  88.6  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 188 aa  87.8  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 198 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 		 202 aa  86.7  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 229 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  37.78 
 
 		 190 aa  86.3  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 189 aa  85.5  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 198 aa  85.1  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  33.84 
 
 		 217 aa  84.7  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1551  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1574  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  35.86 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  37.16 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  30.98 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 266 aa  71.2  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  37.07 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  34.87 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  42.59 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  52.38 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1574  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  57.38 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2615  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  41.07 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>