More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2753 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 197 aa  384  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  43.96 
 
 		 203 aa  125  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  45 
 
 		 190 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  44.38 
 
 		 174 aa  123  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 174 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 188 aa  118  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  40.56 
 
 		 186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  43.22 
 
 		 202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  43.62 
 
 		 195 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2829  regulatory protein TetR  41.88 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 184 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 		 189 aa  102  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 193 aa  101  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  44.39 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 214 aa  99.4  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 250 aa  99  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 188 aa  98.6  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 194 aa  97.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 188 aa  96.3  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  53.92 
 
 		 183 aa  95.9  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  34.22 
 
 		 231 aa  95.9  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 201 aa  95.9  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 199 aa  95.5  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 223 aa  94.4  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
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NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 185 aa  92  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 199 aa  91.7  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  39.67 
 
 		 188 aa  91.3  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 188 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 199 aa  90.5  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  38.01 
 
 		 192 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 192 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 184 aa  89  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  39.31 
 
 		 190 aa  89  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 205 aa  88.6  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  51.65 
 
 		 194 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 193 aa  85.5  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  35.36 
 
 		 189 aa  85.5  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 299 aa  85.5  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  50.55 
 
 		 194 aa  84.7  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  50.55 
 
 		 194 aa  84.7  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 194 aa  84.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
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NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 219 aa  84.7  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  46.39 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
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NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  37.42 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 309 aa  82  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 236 aa  81.6  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 195 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  52.22 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  37.95 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  36.77 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  34.25 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10067  TetR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.504189 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  39.55 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  34.21 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
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NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  30.73 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  50.54 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  34.17 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  54.69 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  36.53 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_1559  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 221 aa  72  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  0.011068 
 
 
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NC_009921  Franean1_0927  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 215 aa  71.2  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.468026  normal  0.980038 
 
 
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NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  34.8 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
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NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
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NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
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