More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4153 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  54.97 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  54.26 
 
 		 203 aa  181  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  51.93 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  51.91 
 
 		 195 aa  165  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  49.39 
 
 		 184 aa  145  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  48.78 
 
 		 184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  48.44 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 189 aa  130  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 184 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  42.7 
 
 		 174 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  47.89 
 
 		 209 aa  118  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  34.43 
 
 		 182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 193 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  42.07 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  35.9 
 
 		 231 aa  106  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  39.01 
 
 		 188 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  40.86 
 
 		 188 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 250 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  41.81 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  42.16 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 194 aa  99  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 207 aa  99  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 259 aa  98.2  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 199 aa  98.2  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  38.17 
 
 		 207 aa  97.8  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 188 aa  96.3  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 194 aa  96.3  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 197 aa  95.9  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 189 aa  95.9  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 184 aa  94.7  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  38.8 
 
 		 196 aa  95.1  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  37.58 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  39.01 
 
 		 193 aa  94.4  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2829  regulatory protein TetR  41.3 
 
 		 203 aa  92.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 193 aa  91.7  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 266 aa  91.3  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  39.75 
 
 		 208 aa  91.3  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 196 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 194 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 194 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 199 aa  88.6  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 176 aa  89  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 201 aa  88.2  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  38.89 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 193 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  35.83 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 184 aa  87  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  37.24 
 
 		 227 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 229 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  33.84 
 
 		 205 aa  85.9  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  51.55 
 
 		 183 aa  85.5  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 199 aa  84.7  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 181 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 184 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  36.45 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10067  TetR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.504189 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  38.62 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5586  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  36.6 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1551  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1574  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 299 aa  74.7  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0927  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.468026  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4273  regulatory protein TetR  33.71 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.532743  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  36.31 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  40.38 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>