More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0927 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0927  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  423  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.468026  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  61.26 
 
 		 207 aa  231  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  59.02 
 
 		 184 aa  207  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 201 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 201 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 201 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  58.95 
 
 		 202 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  50.27 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 193 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 193 aa  153  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  48.4 
 
 		 195 aa  149  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2097  TetR family transcriptional regulator  53.16 
 
 		 158 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.530578  normal  0.137365 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3165  TetR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 195 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.871472  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  46.23 
 
 		 196 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 196 aa  135  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4273  regulatory protein TetR  47.37 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.532743  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  37.97 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2205  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 209 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 		 189 aa  111  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  42.46 
 
 		 186 aa  108  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  38.8 
 
 		 188 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  42.13 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  38.86 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  40.88 
 
 		 188 aa  99.4  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 193 aa  99  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 189 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  39.11 
 
 		 188 aa  96.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 199 aa  95.9  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 201 aa  95.5  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 176 aa  94.7  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  36.16 
 
 		 174 aa  93.6  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 214 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 201 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  38.92 
 
 		 197 aa  92.8  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1551  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 178 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1574  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 178 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 174 aa  92  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  37.22 
 
 		 190 aa  92  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 203 aa  91.7  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 192 aa  92  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  35.48 
 
 		 197 aa  91.3  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 188 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  36.41 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 195 aa  89.4  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  38.85 
 
 		 229 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  34.03 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 184 aa  88.6  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 		 186 aa  88.2  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  37.95 
 
 		 202 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 193 aa  85.5  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 181 aa  85.1  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  34.81 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 199 aa  81.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  33.67 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 217 aa  78.2  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  34.2 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2615  transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  40.91 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  30.62 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  46.59 
 
 		 183 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2786  regulatory protein TetR  31.38 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>