More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3217 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  411  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  45.51 
 
 		 176 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  45.56 
 
 		 181 aa  133  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  41.21 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  45.12 
 
 		 202 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 195 aa  132  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  40.56 
 
 		 204 aa  126  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 198 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  39.57 
 
 		 198 aa  125  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1551  TetR family transcriptional regulator  44.89 
 
 		 178 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1574  TetR family transcriptional regulator  44.89 
 
 		 178 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  40.5 
 
 		 209 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  43.2 
 
 		 229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  41.9 
 
 		 186 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 196 aa  104  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  44.59 
 
 		 199 aa  104  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  36.9 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 193 aa  99.4  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
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NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  36.22 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
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NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 189 aa  93.2  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
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NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  42.21 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  40.76 
 
 		 188 aa  91.7  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 192 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 184 aa  88.2  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  40.11 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
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NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 193 aa  84.7  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
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NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  39.01 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  36.87 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 184 aa  81.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
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NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  37.44 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 184 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
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NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
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NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0927  TetR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.468026  normal  0.980038 
 
 
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NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  38.12 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  37.91 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  39.87 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3165  TetR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.871472  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 202 aa  72  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  32.79 
 
 		 195 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  38.24 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  32.43 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2829  regulatory protein TetR  38.04 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0331  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  30.16 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  47.19 
 
 		 183 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4273  regulatory protein TetR  36.18 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.532743  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  34.34 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  30.87 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  43.53 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  33.33 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_2615  transcriptional regulator, TetR family  36.57 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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