More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4064 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  100 
 
 		 190 aa  364  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  55.62 
 
 		 188 aa  166  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  47.49 
 
 		 174 aa  131  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  43.89 
 
 		 188 aa  128  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  45.25 
 
 		 174 aa  128  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  45.65 
 
 		 188 aa  128  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  41.99 
 
 		 196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  39.49 
 
 		 231 aa  118  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  44.13 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 201 aa  110  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  41.9 
 
 		 186 aa  109  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 192 aa  108  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  39.59 
 
 		 192 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 209 aa  104  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 194 aa  104  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  38.74 
 
 		 192 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 199 aa  101  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 199 aa  101  8e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  38.86 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  40.91 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  39.04 
 
 		 196 aa  99.4  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 193 aa  97.8  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  40.66 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 250 aa  95.9  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  39.11 
 
 		 190 aa  96.3  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2205  transcriptional regulator, TetR family  44.14 
 
 		 196 aa  95.9  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  41.71 
 
 		 209 aa  94.4  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 193 aa  94.4  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  43.09 
 
 		 185 aa  94  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 202 aa  91.7  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 299 aa  91.7  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 184 aa  90.9  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 201 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 201 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 179 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 201 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0927  TetR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.468026  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 213 aa  89.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  41.99 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 194 aa  89.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 205 aa  89  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  39.74 
 
 		 223 aa  89  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 192 aa  88.2  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  35.71 
 
 		 211 aa  87  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 229 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 229 aa  87.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 217 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 208 aa  86.3  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 		 196 aa  85.5  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 		 213 aa  85.1  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  39.23 
 
 		 195 aa  85.1  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4273  regulatory protein TetR  37.7 
 
 		 190 aa  84.3  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.532743  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  33.54 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  38.59 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  34.97 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  36.1 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3165  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.871472  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  37.64 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  40.11 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  38.61 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2829  regulatory protein TetR  38.46 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10067  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.504189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  40.44 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  36.6 
 
 		 227 aa  77.8  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 204 aa  77.8  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2615  transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  34.33 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  36.69 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>