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for query gene Franean1_6690 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
250 aa  486  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  42.6 
 
 
174 aa  108  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  41.42 
 
 
174 aa  105  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 
203 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
201 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
196 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  38.12 
 
 
188 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  44.58 
 
 
197 aa  99  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 
193 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  42.77 
 
 
214 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  37.71 
 
 
190 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  36.69 
 
 
199 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
192 aa  92  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  35.85 
 
 
231 aa  92  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 
192 aa  92  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  37.82 
 
 
209 aa  90.9  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 
186 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  38.01 
 
 
195 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  41.4 
 
 
190 aa  89  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
201 aa  88.2  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
184 aa  88.6  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
184 aa  87  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 
184 aa  87  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 
207 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
194 aa  86.3  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 
183 aa  86.3  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 
189 aa  85.9  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  48.04 
 
 
196 aa  85.9  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  37.27 
 
 
259 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  44.35 
 
 
188 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  42.94 
 
 
185 aa  84  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 
198 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  40.76 
 
 
184 aa  83.2  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
198 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
195 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  47.57 
 
 
202 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 
207 aa  81.6  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  35.22 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  44.66 
 
 
199 aa  79.7  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 
229 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  45.92 
 
 
176 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 
211 aa  78.2  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  33.92 
 
 
188 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  41.51 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  34.55 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  48.15 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 
192 aa  75.1  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  41.9 
 
 
193 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04693  transcriptional regulator TetR/acrR family  36 
 
 
232 aa  74.7  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  38.12 
 
 
207 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0331  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
211 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1551  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  36 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1574  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  38.85 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
194 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  35.93 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
194 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  38.69 
 
 
236 aa  72  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 
213 aa  72  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
223 aa  71.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  36.22 
 
 
208 aa  71.6  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  40.59 
 
 
201 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  40.59 
 
 
201 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  40.59 
 
 
201 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  45.19 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  34.3 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  56.14 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1213  regulatory protein TetR  33.97 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.02381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal 
 
 
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NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
192 aa  68.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 
202 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
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NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 
202 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal 
 
 
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NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  41.05 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
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NC_009664  Krad_2205  transcriptional regulator, TetR family  37.2 
 
 
196 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009921  Franean1_1574  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0394993 
 
 
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NC_013521  Sked_27910  transcriptional regulator, tetR family  45.71 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.794272 
 
 
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NC_013526  Tter_2786  regulatory protein TetR  38.62 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  42.72 
 
 
193 aa  65.5  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  60.71 
 
 
223 aa  65.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
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