More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3163 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 223 aa  437  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  58.79 
 
 		 199 aa  205  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  50.56 
 
 		 188 aa  165  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 299 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 184 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 209 aa  99.4  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 185 aa  98.6  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 189 aa  97.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  37.91 
 
 		 259 aa  92.8  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  38.12 
 
 		 220 aa  91.7  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 223 aa  91.7  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 199 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 201 aa  90.9  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  34.02 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 188 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 205 aa  85.5  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  41.59 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  31.69 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 309 aa  78.2  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4496  TetR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4583  TetR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4879  TetR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 174 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5586  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4504  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  32.2 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 184 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  33.15 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 193 aa  72  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 206 aa  72  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  33.1 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  32.92 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1492  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 186 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10067  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.504189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  34.32 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1574  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  32.94 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2786  regulatory protein TetR  30.53 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 183 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
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NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  28.18 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
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NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 188 aa  62  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 217 aa  62  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 184 aa  62  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 189 aa  62  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
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NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  38.89 
 
 		 202 aa  62  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
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NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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