More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2402 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 259 aa  524  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  46.47 
 
 		 299 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 309 aa  152  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 185 aa  102  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 188 aa  97.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 201 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  42.05 
 
 		 232 aa  96.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  36.81 
 
 		 174 aa  97.1  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 223 aa  96.3  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 199 aa  95.5  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 174 aa  94.7  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  37.91 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10067  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 189 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.504189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 236 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 209 aa  90.1  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 192 aa  90.1  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 205 aa  90.1  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 193 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 194 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 189 aa  89.7  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 186 aa  89  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 194 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 194 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 188 aa  87.4  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 188 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  34.39 
 
 		 182 aa  87  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 196 aa  87  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 189 aa  86.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  40.17 
 
 		 202 aa  85.9  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 199 aa  86.3  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 250 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  37.95 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  37.42 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  30.34 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 194 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 184 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 222 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 208 aa  81.6  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 179 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1492  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 200 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 186 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21000  transcriptional regulator, tetR family  35.91 
 
 		 199 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  0.198219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 173 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  29.26 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  37.74 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  33.69 
 
 		 206 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 186 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21920  transcriptional regulator  36 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.048177  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  53.62 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  35.14 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1574  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  37.01 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 216 aa  72  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 229 aa  72  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 195 aa  72  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 183 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 207 aa  71.6  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_4496  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  36.88 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_4583  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.204371 
 
 
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NC_009077  Mjls_4879  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.089814 
 
 
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NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  34.06 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
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NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
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