201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2459 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 198 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  78.68 
 
 		 198 aa  297  7e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  68.95 
 
 		 199 aa  258  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  63.44 
 
 		 195 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  61.33 
 
 		 196 aa  229  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 186 aa  131  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 207 aa  125  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 189 aa  114  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 176 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  35.39 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1551  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 178 aa  101  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1574  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 178 aa  101  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  99  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  31.72 
 
 		 197 aa  95.9  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 184 aa  94.7  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  35.39 
 
 		 196 aa  94.4  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 194 aa  91.3  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 211 aa  90.5  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 192 aa  89.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 196 aa  89.4  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  31.35 
 
 		 211 aa  89.4  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 201 aa  88.6  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 193 aa  88.2  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  86.7  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 207 aa  85.1  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 193 aa  84.3  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  30.17 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  32.47 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  32.79 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3165  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.871472  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  39.55 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4273  regulatory protein TetR  34.48 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.532743  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 193 aa  72  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 186 aa  72  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2205  transcriptional regulator, TetR family  36.75 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2829  regulatory protein TetR  30.6 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  34.19 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  37.74 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  37.86 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  34.68 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  32.9 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 229 aa  62  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0927  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.468026  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1559  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10067  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.504189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  26.11 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 309 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  30.06 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5106  putative transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586714 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>