209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2829 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2829  regulatory protein TetR  100 
 
 		 203 aa  387  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  51.91 
 
 		 202 aa  141  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  48.35 
 
 		 211 aa  131  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  47.22 
 
 		 189 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  41.88 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  43.65 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  46.19 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 201 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 		 203 aa  92.8  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  38.34 
 
 		 188 aa  92.4  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 193 aa  91.7  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 194 aa  89.4  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 183 aa  88.2  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  39.11 
 
 		 195 aa  88.2  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 189 aa  87.8  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 194 aa  85.9  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 192 aa  85.1  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  36.76 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  43.12 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  37.91 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  38.07 
 
 		 190 aa  77.8  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 259 aa  75.1  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0982  regulatory protein TetR  38.38 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  33.15 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  41.53 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 198 aa  72  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  41.53 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  38.12 
 
 		 184 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  36.22 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  40.86 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 181 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  39.8 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  53.03 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  40.18 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  42.52 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21920  transcriptional regulator  58.06 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.048177  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  34.3 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  38.53 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
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NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  36.97 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
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NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
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NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_1559  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  0.011068 
 
 
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