More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1922 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 201 aa  407  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  35.6 
 
 		 251 aa  116  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 324 aa  98.2  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 221 aa  71.2  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  35.92 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  39.8 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 310 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  36.36 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  30.67 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3349  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.545743 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  34.41 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  45.59 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  45.59 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  37.86 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 222 aa  62  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  41.57 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5683  TetR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17527  hitchhiker  0.003772 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4062  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  35.2 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  39.05 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2368  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000142624 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3179  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  55.93 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  34.26 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  46.58 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  39.45 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  29.2 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  47.14 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>