More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1516 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  433  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0954  transcriptional regulator, TetR family  58.57 
 
 		 213 aa  235  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3447  regulatory protein TetR  58.88 
 
 		 199 aa  229  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  46.39 
 
 		 211 aa  144  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10277  transcriptional regulator  38 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.133301 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 207 aa  125  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0406  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 206 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 206 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 200 aa  97.4  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 224 aa  92  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  32.68 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2703  TetR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 228 aa  88.6  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 213 aa  85.5  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.349703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1152  transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  55 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6448  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264064  hitchhiker  1.59583e-16 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2524  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000581245  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  58 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  58 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  58 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  51.92 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  40.28 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  30.62 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2762  transcriptional regulator, TetR family  24.77 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000444516 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  27 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2560  TetR family transcriptional regulator  20.29 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.282393  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 258 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2639  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2489  TetR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.371609  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4193  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 302 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0423044  normal  0.257514 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  29.72 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4122  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>