More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0313 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  414  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 211 aa  201  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 212 aa  184  6e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 209 aa  182  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 211 aa  175  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 203 aa  174  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 201 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 195 aa  129  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 195 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 195 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 195 aa  114  8.999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 376 aa  102  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0358  regulatory protein, TetR  32.5 
 
 		 240 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667156 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 200 aa  85.5  5e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0533  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 398 aa  75.1  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0165878  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0583  regulatory protein, TetR  25.81 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  27.89 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 218 aa  62  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  52.46 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1179  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  24.46 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  24.37 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 497 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2712  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  48.98 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3641  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1799  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  0.822653 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2525  transcriptional regulator, TetR family  21.76 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  hitchhiker  0.00170542 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1821  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2164  regulatory protein, TetR  28.04 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0566  transcription regulator protein  30.38 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000411686  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 186 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.349703 
 
 
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NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
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NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
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NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_0320  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003909  BCE_2788  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000644753  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
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NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
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NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
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NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
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NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_1833  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
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NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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