More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0954 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0954  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 213 aa  436  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  63.05 
 
 		 218 aa  249  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3447  regulatory protein TetR  59.69 
 
 		 199 aa  239  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  42.58 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0406  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 212 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 206 aa  125  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 206 aa  125  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10277  transcriptional regulator  35.15 
 
 		 206 aa  118  7e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.133301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 207 aa  99  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 200 aa  98.2  8e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.349703 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  29.15 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1152  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 269 aa  65.1  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2703  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 201 aa  62  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 222 aa  62  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  33.87 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3516  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1972  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000120212  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  31.97 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1417  TetR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22703  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  29.27 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 346 aa  55.1  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0636  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0304513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4122  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 243 aa  54.3  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3179  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  26.04 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 287 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 125 aa  53.1  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>