More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2560 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2560  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  418  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.282393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2788  TetR family transcriptional regulator  83.74 
 
 		 203 aa  350  8e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000644753  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2568  TetR family transcriptional regulator  82.76 
 
 		 203 aa  349  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2754  TetR family transcriptional regulator  82.76 
 
 		 203 aa  349  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.864254  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2762  transcriptional regulator, TetR family  82.27 
 
 		 203 aa  348  3e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000444516 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2767  transcriptional regulator, TetR family  82.76 
 
 		 203 aa  346  1e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.430405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2524  TetR family transcriptional regulator  81.77 
 
 		 203 aa  345  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000581245  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2489  TetR family transcriptional regulator  81.28 
 
 		 203 aa  344  6e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.371609  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2809  transcriptional regulator, TetR family  81.28 
 
 		 203 aa  342  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2525  transcriptional regulator, TetR family  80.3 
 
 		 203 aa  337  5e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  hitchhiker  0.00170542 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  25.63 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3103  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  22.4 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3432  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0339823  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  20.29 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 250 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  24.46 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 218 aa  52.4  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  26.72 
 
 		 233 aa  52.4  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 297 aa  52  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1323  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 257 aa  51.6  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  22.65 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 248 aa  51.2  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  21.74 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  22.98 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 242 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  26.61 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  24.15 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  23.9 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.349703 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 254 aa  48.5  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 210 aa  48.1  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 235 aa  48.1  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4551  transcriptional regulator, N-terminus  25.47 
 
 		 112 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0005  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0931339  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  19.79 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1835  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2774  transcriptional regulator, TetR family  24.36 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0349028  normal  0.98242 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  25.51 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  22.61 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  20.63 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  19.91 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0533  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 398 aa  46.2  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0165878  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 236 aa  46.2  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1702  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2910  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  30.95 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1256  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259056 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  27.34 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4468  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>