More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1152 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1152  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 203 aa  408  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  50.25 
 
 		 213 aa  198  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.349703 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  39.3 
 
 		 211 aa  141  7e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  45.77 
 
 		 224 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2703  TetR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 218 aa  99.4  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 223 aa  98.2  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 242 aa  95.5  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3447  regulatory protein TetR  32.74 
 
 		 199 aa  87.8  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0954  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4627  regulatory protein TetR  28.06 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0465  hypothetical protein  33.1 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0115  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8486  putative transcriptional regulator, TetR family  34.1 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  0.72211 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2762  transcriptional regulator, TetR family  21.43 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000444516 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10277  transcriptional regulator  26.94 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.133301 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2525  transcriptional regulator, TetR family  21.94 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  hitchhiker  0.00170542 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  27.19 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  25.76 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2568  TetR family transcriptional regulator  20.92 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2754  TetR family transcriptional regulator  20.92 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.864254  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4638  putative transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2489  TetR family transcriptional regulator  20.92 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.371609  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2788  TetR family transcriptional regulator  21.94 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000644753  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 247 aa  53.9  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3161  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 247 aa  53.9  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  40.3 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 250 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 446 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 259 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  44.87 
 
 		 230 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 259 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 257 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 259 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 203 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 219 aa  52  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  26.07 
 
 		 309 aa  52.4  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  30.24 
 
 		 242 aa  52  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0406  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  32.62 
 
 		 225 aa  52  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 266 aa  51.6  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 214 aa  51.6  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 197 aa  51.6  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>