More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3071 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  421  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8486  putative transcriptional regulator, TetR family  73.33 
 
 		 201 aa  275  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  0.72211 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  59.04 
 
 		 239 aa  221  7e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0115  transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 		 199 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0465  hypothetical protein  55.56 
 
 		 200 aa  182  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  39 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  34.58 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  36.29 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  33.88 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  50.79 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  47.17 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  32.29 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  29.35 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  47.27 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4031  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  39.06 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  33.33 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  33.33 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  33.33 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  33.33 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  33.33 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  33.33 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  40.98 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 261 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>