More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4543 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 205 aa  411  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  58.95 
 
 		 202 aa  215  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2925  transcriptional regulator, TetR family  61.22 
 
 		 198 aa  209  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  46.33 
 
 		 222 aa  141  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  45.81 
 
 		 211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  40.85 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  39.39 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  41.71 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2693  regulatory protein TetR  43.1 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0770653  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  39.08 
 
 		 197 aa  116  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  38.02 
 
 		 195 aa  116  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 197 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 197 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  36.93 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  42.13 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  41.04 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 197 aa  108  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 		 196 aa  108  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  37.64 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 199 aa  105  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 195 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  38.32 
 
 		 192 aa  101  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  38.95 
 
 		 196 aa  94.7  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 201 aa  87.8  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0972  transcriptional regulator, TetR family  40.4 
 
 		 194 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0921311  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6079  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.615867 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  30.93 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  32.32 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0626  TetR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1526  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8486  putative transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  0.72211 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53410  transcriptional regulator  37.35 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.733487  normal  0.037637 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0195  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.5282  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4681  transcriptional regulator  37.35 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.55 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4799  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.55 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.55 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.55 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5341  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.55 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4813  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 259 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5405  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5456  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.31437 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 259 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  34.29 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  40.48 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1620  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0021024  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0444  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0086  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0095  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0333517 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>