More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5281 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 257 aa  507  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  84.82 
 
 		 254 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  86.16 
 
 		 237 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  64.92 
 
 		 259 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  64.92 
 
 		 259 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  64.92 
 
 		 259 aa  316  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 250 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  59.65 
 
 		 241 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6467  transcriptional regulator, TetR family  35.89 
 
 		 217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1179  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 290 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  37.26 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0727  transcriptional regulator, TetR family  36.2 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3329  transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 		 217 aa  96.7  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181798  normal  0.116616 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2817  transcriptional regulator, TetR family  39.07 
 
 		 210 aa  95.1  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4909  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 222 aa  87  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3748  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3022  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3516  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 197 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  35.11 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  44.3 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 194 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2293  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1408  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1058  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0121  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1493  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0974  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.543907  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0527  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.474473  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  49.23 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 206 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  43.28 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1256  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259056 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0747  putative transcriptional regulator, TetR family  25.63 
 
 		 187 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24477  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3613  regulatory protein, TetR  41.33 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  35.37 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1000  regulatory protein, TetR  26.03 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  35.51 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 335 aa  55.8  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4816  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0244477 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 211 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6328  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 199 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00138827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4572  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.270475 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 200 aa  55.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 206 aa  55.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2512  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290305  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 209 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  25.62 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 497 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 201 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 199 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 195 aa  53.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 200 aa  53.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 198 aa  53.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2910  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 225 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  27.7 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 231 aa  53.9  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 198 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0636  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 250 aa  53.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0304513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>