133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4909 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4909  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  473  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3329  transcriptional regulator, TetR family  55.92 
 
 		 217 aa  223  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181798  normal  0.116616 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0727  transcriptional regulator, TetR family  53.24 
 
 		 216 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  49.52 
 
 		 288 aa  191  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2817  transcriptional regulator, TetR family  53.43 
 
 		 210 aa  185  7e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6467  transcriptional regulator, TetR family  39.59 
 
 		 217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 254 aa  95.9  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 241 aa  91.7  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1179  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 290 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3516  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 299 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0035  putative transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 184 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 259 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2028  TetR family transcriptional regulator  22.47 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3022  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 305 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  23.89 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3748  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  26.82 
 
 		 390 aa  49.7  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 222 aa  49.3  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 195 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 195 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 202 aa  48.9  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 195 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 201 aa  48.5  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3306  regulatory protein TetR  41.94 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000516611  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3028  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.851198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 201 aa  47  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 179 aa  47  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 237 aa  46.2  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 246 aa  46.2  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 233 aa  46.2  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1121  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 220 aa  45.8  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.2139 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5230  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 228 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 288 aa  45.8  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 206 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  28.57 
 
 		 252 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2813  regulatory protein TetR  32.5 
 
 		 182 aa  45.4  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0628  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 262 aa  45.4  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0323336 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 226 aa  45.4  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 212 aa  45.1  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 212 aa  45.1  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 266 aa  45.1  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6844  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  26.25 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  40 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1382  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 196 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  34.25 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0030  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0927  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.468026  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  22.1 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 198 aa  44.3  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0358  regulatory protein, TetR  43.4 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0652  Transcriptional regulator protein  41.67 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02120  transcriptional regulator, tetR family  55.56 
 
 		 194 aa  43.5  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.19222  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1650  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 218 aa  43.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  27.89 
 
 		 200 aa  43.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10067  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 189 aa  43.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.504189 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0747  putative transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 187 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24477  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 220 aa  43.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  28.64 
 
 		 211 aa  42.7  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 200 aa  42.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>