187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2817 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2817  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 210 aa  410  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4909  TetR family transcriptional regulator  53.43 
 
 		 237 aa  211  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0727  transcriptional regulator, TetR family  53.73 
 
 		 216 aa  202  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3329  transcriptional regulator, TetR family  50.72 
 
 		 217 aa  197  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181798  normal  0.116616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 288 aa  177  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6467  transcriptional regulator, TetR family  41.05 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  42.26 
 
 		 223 aa  128  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 259 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 259 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 259 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 237 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 254 aa  99.8  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 257 aa  98.6  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 241 aa  96.3  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 250 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1179  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3516  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 305 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 184 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 204 aa  52  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  24.83 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  51.06 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 259 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 198 aa  48.5  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 208 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0358  regulatory protein, TetR  36.78 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667156 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2910  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  41.82 
 
 		 179 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 309 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  29.57 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  36.19 
 
 		 252 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 297 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1094  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3914  putative transcriptional regulator  40.85 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.201642  normal  0.600336 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2656  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 233 aa  46.2  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  28.1 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3613  regulatory protein, TetR  39.44 
 
 		 243 aa  45.8  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1594  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000148614  unclonable  0.000000209189 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0123  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 191 aa  45.8  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 234 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 202 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 299 aa  45.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 195 aa  45.4  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 226 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 209 aa  45.4  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3011  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 214 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0859343 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  45.4  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 181 aa  45.1  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 200 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 210 aa  45.1  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3553  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.500909  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4587  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3626  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.757995 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1626  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432632 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3558  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03580  DNA-binding transcriptional repressor FabR  40.26 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.163329  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3306  regulatory protein TetR  40.68 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000516611  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0652  Transcriptional regulator protein  40.98 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 376 aa  43.5  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>