212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2990 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 288 aa  588  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0727  transcriptional regulator, TetR family  52.45 
 
 		 216 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4909  TetR family transcriptional regulator  49.52 
 
 		 237 aa  191  9e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6467  transcriptional regulator, TetR family  48.06 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3329  transcriptional regulator, TetR family  45.59 
 
 		 217 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181798  normal  0.116616 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 223 aa  166  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2817  transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 		 210 aa  162  7e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 259 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 259 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 259 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 237 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 254 aa  122  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1179  TetR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3516  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3028  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.851198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  26.61 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3748  TetR family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 204 aa  55.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4300  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 236 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3022  TetR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 233 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 202 aa  53.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  32.29 
 
 		 186 aa  52.8  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2910  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 215 aa  52.4  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 224 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 212 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6450  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 205 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4816  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 244 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0244477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 205 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  41.11 
 
 		 211 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1827  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 246 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1874  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 246 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0418563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1808  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 246 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 199 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 208 aa  49.3  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 204 aa  48.9  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1509  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 179 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0671702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  27.4 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 212 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3755  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3828  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1541  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.932149  normal  0.0804871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4220  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3767  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5275  putative transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 203 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.398681  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3559  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  24.88 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00735263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2813  regulatory protein TetR  32.46 
 
 		 182 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1121  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 220 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.2139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1978  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 179 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0203016  normal  0.0208763 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6844  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 203 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  37.97 
 
 		 205 aa  47  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3306  regulatory protein TetR  42.42 
 
 		 189 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000516611  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0327  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 186 aa  47  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 196 aa  46.6  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1814  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 216 aa  47  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 196 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 206 aa  47  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 211 aa  46.6  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 211 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2432  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 239 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.625789 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 224 aa  46.2  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 218 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 238 aa  46.2  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 192 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 215 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 215 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 224 aa  46.2  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 215 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  33.8 
 
 		 195 aa  46.2  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3647  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  24.88 
 
 		 220 aa  46.2  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0126984  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5230  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 228 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 195 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 195 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 212 aa  45.8  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 234 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1188  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 215 aa  45.8  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 209 aa  45.8  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0137  DNA-binding transcriptional repressor FabR  28.85 
 
 		 205 aa  45.8  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00297198  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03073  hypothetical protein  24.88 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.807649  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0198  DNA-binding transcriptional repressor FabR  28.85 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4724  regulatory protein, TetR  32.84 
 
 		 191 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0179  DNA-binding transcriptional repressor FabR  28.85 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00396424  normal  0.0559762 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 333 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4180  DNA-binding transcriptional repressor FabR  28.85 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0026827  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 205 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3749  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  24.88 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000431628  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1203  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 203 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>