230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5230 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5230  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  461  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0626  TetR family transcriptional regulator  66 
 
 		 244 aa  270  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.852372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0418  hypothetical protein  56.84 
 
 		 195 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2603  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3278  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2339  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 208 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249237 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2432  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.625789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4300  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4220  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2300  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2347  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0682211  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3791  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353737  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3755  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3828  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3767  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  30.91 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3329  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 217 aa  52  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181798  normal  0.116616 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  34.41 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3973  regulatory protein TetR  38.55 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21920  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.048177  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4799  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5341  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2689  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 200 aa  49.7  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 266 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0195  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 194 aa  49.3  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.5282  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 219 aa  49.3  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 219 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 199 aa  48.9  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 199 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 230 aa  48.5  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 257 aa  48.5  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  30.28 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 194 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  32.43 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4813  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 186 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5405  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 195 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5456  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 195 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.31437 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1323  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 197 aa  47  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 288 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 186 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 241 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0727  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 225 aa  46.6  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6264  putative transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.085092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 179 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0808  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4909  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5421  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 182 aa  46.2  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.211014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 197 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0048  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 204 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 211 aa  45.8  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0959  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 225 aa  45.8  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 190 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5132  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 211 aa  45.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.60522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 193 aa  45.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 201 aa  45.8  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 205 aa  45.4  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 201 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 201 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 201 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 299 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 202 aa  45.4  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  46.81 
 
 		 205 aa  45.4  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 198 aa  45.4  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 231 aa  45.1  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  24.48 
 
 		 202 aa  45.1  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 209 aa  45.1  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 206 aa  45.1  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 201 aa  45.1  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2048  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 249 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>