93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0959 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0959  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  460  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6862  TetR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 224 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000147849  normal  0.19991 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 244 aa  95.1  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6386  regulatory protein, TetR  27.37 
 
 		 510 aa  89.7  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4438  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 477 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.829211  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4328  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 477 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0701267  normal  0.0216349 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1498  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.548232  normal  0.295378 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0161  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 125 aa  52  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1704  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 285 aa  49.7  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0517004  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  27.49 
 
 		 208 aa  48.9  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  28.32 
 
 		 197 aa  48.5  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  19.05 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4350  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4304  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.0930958 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1548  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5829  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  27.97 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5031  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201359  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6843  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.163651  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 189 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  25.88 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  24.03 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 242 aa  46.2  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  28.57 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 242 aa  45.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 189 aa  45.8  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34550  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00167706  normal  0.63182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 207 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 185 aa  45.4  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6831  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 223 aa  45.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1423  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5045  transcriptional regulator, TetR family  29.92 
 
 		 208 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.301448 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5230  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  29.89 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 201 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 414 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 200 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0048  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3581  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 198 aa  43.5  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  29.01 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  23.14 
 
 		 197 aa  43.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 275 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 230 aa  43.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  34.55 
 
 		 207 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 275 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 235 aa  42.4  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 234 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3575  TetR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 200 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 234 aa  42  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 205 aa  42  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 189 aa  42  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 243 aa  42  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  38.89 
 
 		 190 aa  42  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  38.18 
 
 		 210 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  24.59 
 
 		 202 aa  41.6  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3393  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 263 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158575  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 210 aa  41.6  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2312  transcriptional regulator BetI  25.41 
 
 		 194 aa  41.6  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.48058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 238 aa  41.6  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>