More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4438 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4328  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 477 aa  984    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0701267  normal  0.0216349 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4438  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 477 aa  984    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.829211  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6386  regulatory protein, TetR  55.74 
 
 		 510 aa  511  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6862  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 224 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000147849  normal  0.19991 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 228 aa  103  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1684  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 227 aa  95.1  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0161  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 221 aa  94.4  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 244 aa  94.4  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3099  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 222 aa  92.8  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.296713  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0959  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 225 aa  87.8  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1498  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 183 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.548232  normal  0.295378 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1704  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0517004  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 215 aa  65.1  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6831  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 223 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1423  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1733  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 213 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446931  hitchhiker  0.00691691 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  57  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  27.1 
 
 		 193 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 206 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  27.34 
 
 		 193 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 220 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 259 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  22.63 
 
 		 205 aa  55.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 278 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 248 aa  54.7  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 236 aa  54.7  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 234 aa  54.7  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  26.56 
 
 		 214 aa  54.3  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 204 aa  54.3  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1121  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 221 aa  53.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 195 aa  52.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 214 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 245 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 225 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 228 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 287 aa  51.6  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 203 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 199 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 207 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 210 aa  50.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 244 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6034  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 223 aa  50.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 197 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  40.68 
 
 		 346 aa  50.8  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6843  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 236 aa  50.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.163651  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  25.29 
 
 		 195 aa  50.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 236 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 203 aa  50.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 192 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1885  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 196 aa  50.1  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 208 aa  50.1  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 243 aa  50.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 212 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 210 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 332 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 242 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 205 aa  49.7  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 246 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 208 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  30.61 
 
 		 197 aa  49.3  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  45.83 
 
 		 214 aa  48.9  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0611  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 221 aa  49.3  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  36.49 
 
 		 205 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 207 aa  49.3  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 212 aa  48.5  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 207 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 226 aa  48.9  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  24.1 
 
 		 208 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 222 aa  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 210 aa  48.5  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 234 aa  48.5  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 204 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1460  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 210 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 237 aa  47.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 209 aa  48.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4350  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 225 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 213 aa  48.1  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0596  TetR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 203 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 226 aa  47.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 310 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 205 aa  47.8  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 214 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 213 aa  47.4  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 286 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 212 aa  47.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 174 aa  47.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 		 222 aa  47.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 224 aa  47.4  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 207 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 228 aa  47  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 210 aa  47  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 232 aa  47  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 196 aa  47  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 241 aa  47  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>