202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6862 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6862  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000147849  normal  0.19991 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0959  TetR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4438  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 477 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.829211  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4328  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 477 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0701267  normal  0.0216349 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6386  regulatory protein, TetR  31.93 
 
 		 510 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1498  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 183 aa  92.8  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.548232  normal  0.295378 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3099  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.296713  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  22.91 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1684  TetR family transcriptional regulator  21.52 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0161  TetR family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6831  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1423  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1704  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 285 aa  57  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0517004  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6843  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.163651  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 277 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 219 aa  52  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 213 aa  52  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.4 
 
 		 178 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  30.4 
 
 		 178 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  31.43 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  30.4 
 
 		 178 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 278 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 278 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 278 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 178 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 291 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 185 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 275 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 200 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2019  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 235 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 178 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 178 aa  48.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 178 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 178 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 178 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  26.06 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  26.06 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  26.06 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 177 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  34.74 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 204 aa  47  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 188 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1548  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5031  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 258 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201359  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5829  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 258 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1292  regulatory protein TetR  26.23 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5205  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155344  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5654  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.346197  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4350  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 229 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  29.69 
 
 		 186 aa  45.8  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 193 aa  45.8  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  40.32 
 
 		 214 aa  45.8  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5139  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 223 aa  45.4  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3562  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 237 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 214 aa  45.4  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1885  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 196 aa  45.4  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1454  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 231 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 193 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  24.48 
 
 		 197 aa  45.4  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3074  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 202 aa  45.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 222 aa  45.1  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 207 aa  45.1  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  34.25 
 
 		 197 aa  45.1  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 205 aa  45.1  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1139  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 220 aa  45.1  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  34.83 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  27.13 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>