More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4758 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  97.62 
 
 		 210 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  90.43 
 
 		 225 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  90.43 
 
 		 225 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  89.47 
 
 		 225 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  82.78 
 
 		 225 aa  358  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  71.5 
 
 		 210 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  65.55 
 
 		 210 aa  285  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  67.15 
 
 		 214 aa  284  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  65.85 
 
 		 216 aa  278  6e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  63.81 
 
 		 210 aa  274  6e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  63.77 
 
 		 213 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  66.33 
 
 		 243 aa  266  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  65.87 
 
 		 219 aa  263  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  63.77 
 
 		 210 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  56.73 
 
 		 218 aa  231  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3393  TetR family transcriptional regulator  58.16 
 
 		 263 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158575  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  63.49 
 
 		 74 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  42.06 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  62.71 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  46.38 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  55.93 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5134  TetR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 195 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5515  TetR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 195 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  59.32 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  52.17 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5773  transcriptional regulator TetR family  35.61 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  57.41 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  47.46 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 264 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  41.67 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1272  transcriptional regulator, TetR family  52.24 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1551  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6278  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  31.97 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6770  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1920  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1382  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 217 aa  52.8  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  40.91 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3541  transcriptional regulator, TetR family  34.26 
 
 		 221 aa  52  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 230 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  28.82 
 
 		 252 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
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NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 234 aa  51.6  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
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NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 229 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
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NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
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NC_007794  Saro_1704  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 285 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0517004  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
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NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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