More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1173 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 189 aa  381  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2010  transcriptional regulator, TetR family  49.2 
 
 		 193 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.267977  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3575  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5271  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.869889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  28.24 
 
 		 287 aa  68.6  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 232 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  27.38 
 
 		 208 aa  67.8  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2766  regulatory protein, TetR  25 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.597397  hitchhiker  0.0084658 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  24.4 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3213  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000469892  normal  0.140374 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22250  transcriptional regulator  24.69 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0446991  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2800  transcriptional regulator, TetR family  22.87 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3675  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4551  transcriptional regulator, N-terminus  33.72 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 211 aa  57.8  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  33.72 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3662  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3735  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  0.477586 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5635  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0445849  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0474  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.542957  hitchhiker  4.20035e-18 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  32.22 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1561  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0023  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2143  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 249 aa  55.1  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101921  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3590  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3641  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1799  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  0.822653 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6888  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 254 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  34.26 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 232 aa  54.7  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 285 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  30.77 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1067  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4065  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  23.67 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 243 aa  53.9  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1833  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  24.72 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4791  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.131161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>