More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2695 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 185 aa  371  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5867  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 193 aa  88.6  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0832592  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0743  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.803231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  56.6 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  56.6 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  56.6 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  56.6 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  56.6 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  56.6 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  56.6 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  56.6 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  56.6 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 203 aa  62  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 223 aa  62  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 208 aa  62  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  38.55 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 205 aa  60.8  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4438  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 477 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.829211  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4328  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 477 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0701267  normal  0.0216349 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  43.86 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  37.62 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 261 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2506  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.733789  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3587  TetR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 200 aa  57  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 222 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  31.12 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  43.64 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  32.45 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  40.43 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2654  regulatory protein TetR  38.36 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2600  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  35.34 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  44.44 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3823  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  43.42 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>