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for query gene PSPA7_3937 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  100 
 
 		 210 aa  417  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  85.17 
 
 		 210 aa  349  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  74.5 
 
 		 214 aa  297  9e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  67.16 
 
 		 213 aa  275  3e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  68.14 
 
 		 216 aa  275  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  63.81 
 
 		 210 aa  274  6e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  65.22 
 
 		 210 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  64.9 
 
 		 225 aa  271  6e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  64.9 
 
 		 225 aa  271  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  64.9 
 
 		 225 aa  271  7e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  63.33 
 
 		 210 aa  270  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 219 aa  268  4e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  63.94 
 
 		 225 aa  264  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  63.68 
 
 		 243 aa  258  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  66.18 
 
 		 210 aa  251  6e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  63.5 
 
 		 218 aa  236  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3393  TetR family transcriptional regulator  57.07 
 
 		 263 aa  231  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158575  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  57.75 
 
 		 74 aa  88.6  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  49.11 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  50.62 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  62.71 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  34.78 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  65.57 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  55.07 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  41.12 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  60.66 
 
 		 205 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  59.68 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  59.68 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  29.72 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  34.73 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  53.73 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  48.75 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 253 aa  67  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_1272  transcriptional regulator, TetR family  59.09 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5134  TetR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5515  TetR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 218 aa  62  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5773  transcriptional regulator TetR family  35.83 
 
 		 208 aa  62  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  45.76 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  48.28 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  45 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1551  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6278  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185779  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1981  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.992174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4953  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281079  normal  0.71404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7032  transcriptional regulator TetR family  37.7 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6770  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4581  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.19483 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1920  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
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NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
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NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
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NC_013522  Taci_1382  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011726  PCC8801_0829  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  41.94 
 
 		 258 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
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NC_013161  Cyan8802_0857  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.999415 
 
 
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