264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0927 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
195 aa  381  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
195 aa  381  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  98.46 
 
 
195 aa  377  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3838  transcriptional regulator, TetR family  57.44 
 
 
213 aa  199  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2575  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 
183 aa  161  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 
232 aa  94.4  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  38.15 
 
 
222 aa  92.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  36.04 
 
 
197 aa  90.5  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  35.5 
 
 
230 aa  89  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  35.54 
 
 
206 aa  88.6  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 
243 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  35.84 
 
 
229 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  33.99 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0197  putative transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 
209 aa  71.2  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
226 aa  67.4  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
218 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 
203 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3310  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 
256 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000381613  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4241  hypothetical protein  34.86 
 
 
206 aa  59.3  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  32.58 
 
 
190 aa  58.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4916  hypothetical protein  39.25 
 
 
221 aa  58.2  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195255  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 
204 aa  58.2  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0547  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 
249 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 
196 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  34.95 
 
 
201 aa  56.6  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
206 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
212 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 
204 aa  56.2  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
208 aa  55.8  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
197 aa  55.1  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  34.55 
 
 
196 aa  54.7  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  33.58 
 
 
206 aa  54.7  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 
207 aa  54.7  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
206 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  26.54 
 
 
203 aa  54.3  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 
193 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  43.24 
 
 
210 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  26.17 
 
 
199 aa  53.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  26.57 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
203 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2498  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 
184 aa  52.8  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0941  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
239 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 
244 aa  52.8  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1583  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
198 aa  52  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  24.42 
 
 
202 aa  52  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 
221 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3687  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  25 
 
 
220 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0386851 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 
264 aa  51.6  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  20.55 
 
 
205 aa  51.6  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 
208 aa  51.6  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 
204 aa  51.6  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
210 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 
191 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 
204 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3581  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  24.38 
 
 
220 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3580  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  24.38 
 
 
220 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.344721  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3653  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  24.38 
 
 
220 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.451581 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
242 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3750  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  24.38 
 
 
220 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.833551 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2129  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
210 aa  50.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 
196 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 
232 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
200 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4005  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
242 aa  49.3  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 
189 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3536  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
208 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  23.58 
 
 
200 aa  48.9  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
230 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 
243 aa  49.3  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
214 aa  49.3  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
275 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
217 aa  48.9  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
192 aa  48.9  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3217  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
207 aa  48.9  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000141467  hitchhiker  0.00109998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  29.36 
 
 
197 aa  48.9  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 
247 aa  48.5  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 
243 aa  48.9  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
222 aa  48.5  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4995  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 
198 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
275 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
219 aa  48.5  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 
207 aa  48.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
208 aa  48.1  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  25 
 
 
200 aa  47.8  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  27.91 
 
 
215 aa  47.8  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 
277 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 
219 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2994  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
197 aa  47.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383158  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1656  transcriptional regulator, TetR family  25.34 
 
 
206 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 
184 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>