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for query gene Vapar_6209 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
208 aa  420  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 
209 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
218 aa  115  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  36.19 
 
 
225 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  37.19 
 
 
237 aa  114  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
215 aa  98.6  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
205 aa  95.9  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  46.02 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 
207 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  44.25 
 
 
203 aa  89  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  44.25 
 
 
203 aa  89  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  43.7 
 
 
209 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  43.7 
 
 
209 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5515  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
195 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5134  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
198 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
195 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  45.13 
 
 
202 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  54.22 
 
 
213 aa  85.1  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4953  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
184 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281079  normal  0.71404 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1272  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 
176 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388296  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  35.95 
 
 
200 aa  78.2  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  47.3 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1892  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000800916  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  47.22 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
210 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
213 aa  71.2  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  29.72 
 
 
210 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 
214 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  52.38 
 
 
74 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  41.11 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3393  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158575  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
222 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
222 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
216 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 
227 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
225 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
199 aa  63.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  30.97 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 
201 aa  62.8  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
213 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
222 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 
218 aa  61.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
217 aa  61.6  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  37.37 
 
 
210 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  42.42 
 
 
264 aa  60.1  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 
231 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1567  TetR family transcriptional regulator  40.78 
 
 
261 aa  59.3  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
222 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
210 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
222 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
222 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4772  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 
184 aa  58.2  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1159  regulatory protein, TetR  28.5 
 
 
231 aa  58.2  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
218 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
224 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  41.03 
 
 
230 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 
205 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3816  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
231 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
210 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
223 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1035  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
227 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168916  normal  0.097412 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1551  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
221 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
225 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
225 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6278  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
221 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185779  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6770  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
220 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 
226 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.576002 
 
 
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NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 
205 aa  55.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  40.68 
 
 
222 aa  55.8  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
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NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
236 aa  55.5  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal 
 
 
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NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 
207 aa  55.8  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 
226 aa  55.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal 
 
 
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NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 
217 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
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