240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4406 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  448  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4025  regulatory protein, TetR  96.45 
 
 		 197 aa  383  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  61.93 
 
 		 215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  57.36 
 
 		 210 aa  241  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 229 aa  230  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0566  transcriptional regulator, TetR family  57.29 
 
 		 193 aa  224  6e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  54.19 
 
 		 264 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  55.28 
 
 		 212 aa  219  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4772  transcriptional regulator, TetR family  56.04 
 
 		 184 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  55.67 
 
 		 196 aa  209  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 223 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  45.75 
 
 		 218 aa  167  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  45.89 
 
 		 218 aa  164  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  44.39 
 
 		 195 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 218 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 227 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  33 
 
 		 258 aa  89.4  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  27.09 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0829  transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0857  transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.999415 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  33.33 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  38.4 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  41.57 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0481  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.510186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0451  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00762729  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  29.87 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  42.86 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1770  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0437  transcriptional regulator, TetR family  35.07 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5134  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03840  transcriptional regulator AguR  28.64 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4869  regulatory protein, TetR  37.35 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5773  transcriptional regulator TetR family  41.94 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 195 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5515  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 195 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5311  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0385  transcriptional regulator AguR  28.14 
 
 		 211 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  44.07 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 253 aa  52  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2249  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.672555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  46.3 
 
 		 222 aa  52  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6770  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 220 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  28.99 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 74 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1551  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6278  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1272  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388296  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 188 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>