103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0385 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0385  transcriptional regulator AguR  100 
 
 		 211 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03840  transcriptional regulator AguR  98.1 
 
 		 221 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5409  TetR family transcriptional regulator  72.6 
 
 		 208 aa  310  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394363  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5311  transcriptional regulator, TetR family  68.9 
 
 		 210 aa  293  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4869  regulatory protein, TetR  70.79 
 
 		 224 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0339  TetR family transcriptional regulator  74.76 
 
 		 213 aa  290  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0257  TetR family transcriptional regulator  66.03 
 
 		 210 aa  284  5e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0562904  normal  0.0230468 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0242  TetR family transcriptional regulator  66.03 
 
 		 210 aa  284  8e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0183309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0267  TetR family transcriptional regulator  65.55 
 
 		 211 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.700682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4970  TetR family transcriptional regulator  66.35 
 
 		 208 aa  258  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0217357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3257  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255027  decreased coverage  0.000226088 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0249  TetR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 238 aa  101  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2249  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 214 aa  99.4  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.672555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4616  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4356  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3239  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 234 aa  87.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.727709  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4626  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  27.59 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1652  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1329  TetR family transcriptional regulator  22.49 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000000704239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1044  TetR family transcriptional regulator  21.53 
 
 		 230 aa  52  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000181846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 246 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  22.55 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4772  transcriptional regulator, TetR family  22.65 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  46.2  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 191 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1981  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.992174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 191 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 191 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 191 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  32.95 
 
 		 264 aa  45.8  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 197 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4025  regulatory protein, TetR  28.57 
 
 		 197 aa  45.1  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  28.87 
 
 		 198 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 219 aa  45.1  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 218 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  26.44 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1074  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  34.58 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1704  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 285 aa  43.5  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0517004  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  42.03 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0809  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2540  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.34282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  28.72 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4876  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3794  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 191 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.549336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3867  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 191 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 190 aa  42.7  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 214 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  39.39 
 
 		 217 aa  42.4  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5773  transcriptional regulator TetR family  32.81 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  34.94 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  37.29 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2181  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 189 aa  42.4  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000940073  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2583  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 226 aa  42.4  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 202 aa  42  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 202 aa  42  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0347  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 213 aa  42  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421077  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 207 aa  42  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0829  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 218 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0362  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 213 aa  42  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0857  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 218 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.999415 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 222 aa  42  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0992  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 197 aa  42  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 216 aa  42  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 234 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0472  putative transcription regulator protein  33.62 
 
 		 213 aa  41.6  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.19326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 191 aa  42  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 193 aa  41.6  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0445  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 213 aa  41.6  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>