More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4146 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 246 aa  488  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  62.87 
 
 		 236 aa  299  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  62.2 
 
 		 278 aa  280  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  61.3 
 
 		 234 aa  268  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  53.22 
 
 		 230 aa  221  6e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  56.96 
 
 		 227 aa  221  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  49.58 
 
 		 241 aa  191  7e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  45.42 
 
 		 261 aa  188  5.999999999999999e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  45.69 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  47.3 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  46.44 
 
 		 221 aa  181  9.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  46.7 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  47.77 
 
 		 227 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  43.06 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 236 aa  155  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  42.54 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  42.31 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 217 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 217 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5775  hypothetical protein  34.98 
 
 		 227 aa  128  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 217 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 254 aa  123  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 283 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  50 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 235 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 216 aa  118  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  41.15 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  38.89 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  34.58 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1731  hypothetical protein  33.04 
 
 		 227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 232 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 243 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  31.47 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  34.35 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 195 aa  101  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 248 aa  95.5  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 244 aa  92.4  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  29.71 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 235 aa  85.5  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  29.29 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  28.63 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  31.43 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  32.32 
 
 		 196 aa  74.7  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 193 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  28.32 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 174 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 229 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 333 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  28.46 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  36 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 203 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2575  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 183 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 257 aa  52.8  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 203 aa  52.4  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6386  regulatory protein, TetR  35.07 
 
 		 510 aa  52.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  27.87 
 
 		 200 aa  52  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 200 aa  52  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2540  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.34282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 295 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 206 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  24.78 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  29.82 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  38.05 
 
 		 343 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1074  transcriptional regulator, TetR family  48.89 
 
 		 184 aa  50.1  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 209 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>