187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0701 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 261 aa  538  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  52.05 
 
 		 260 aa  261  8e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 237 aa  176  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  35.1 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  37.18 
 
 		 239 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  33.47 
 
 		 250 aa  150  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  38.17 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  32.92 
 
 		 242 aa  139  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  31.8 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 248 aa  109  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 283 aa  109  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  33.6 
 
 		 255 aa  108  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 249 aa  99.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 241 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 227 aa  97.4  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 236 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  27.82 
 
 		 276 aa  92.4  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  28.63 
 
 		 225 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  27.95 
 
 		 230 aa  90.1  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 230 aa  90.5  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 236 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  30.54 
 
 		 251 aa  90.5  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 235 aa  89.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  27.52 
 
 		 230 aa  89  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 217 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 217 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 232 aa  87  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 216 aa  85.5  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 261 aa  85.9  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  28.69 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  28.51 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  25.22 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  37.38 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  29.82 
 
 		 223 aa  72  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  32.76 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  21.08 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  24.89 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1731  hypothetical protein  24.02 
 
 		 227 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 194 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 224 aa  53.9  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 223 aa  53.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 191 aa  52.8  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  31.25 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 333 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2424  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 195 aa  50.4  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351018  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  27.13 
 
 		 203 aa  50.4  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5775  hypothetical protein  18.63 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  21.56 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 212 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 212 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 212 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 307 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 215 aa  49.7  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 191 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 211 aa  48.9  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 203 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  48.5  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  30 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4995  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3515  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 185 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000109065  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  19.83 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  28.32 
 
 		 184 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  20.99 
 
 		 222 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 184 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1515  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 236 aa  46.6  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 189 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 195 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 196 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 196 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 195 aa  46.2  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 196 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0144  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 181 aa  46.2  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 198 aa  46.2  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>