211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2636 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  59.57 
 
 		 195 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  51.06 
 
 		 194 aa  185  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  52.88 
 
 		 193 aa  177  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  49.47 
 
 		 184 aa  159  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  52.66 
 
 		 184 aa  159  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  48.11 
 
 		 200 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  43.18 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  30.65 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 197 aa  86.3  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 200 aa  85.9  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 195 aa  85.9  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  85.5  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 199 aa  84.3  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5095  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.666558  normal  0.638711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20170  hypothetical protein  46.43 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0847124  normal  0.0246462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 257 aa  71.2  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  24.72 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  28.84 
 
 		 307 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4491  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 229 aa  64.7  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2994  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383158  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  28.73 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  30.82 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  23.81 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  34.82 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  29.56 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 319 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0855  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0395  transcriptional regulator  23.17 
 
 		 175 aa  53.1  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1636  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1583  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00970  transcriptional regulator, tetR family  32.69 
 
 		 195 aa  51.6  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  28.74 
 
 		 197 aa  51.6  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 225 aa  51.2  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 234 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1551  hypothetical protein  22.99 
 
 		 196 aa  51.2  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.494685  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0547  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 249 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  25.52 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 261 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>