More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1336 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  419  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 208 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  44.74 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 204 aa  104  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  32.47 
 
 		 190 aa  101  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 199 aa  97.8  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 184 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 184 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 184 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 212 aa  95.9  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 202 aa  95.1  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 203 aa  94.4  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  92.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 193 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 196 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 237 aa  85.9  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 181 aa  86.3  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 194 aa  85.5  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 206 aa  85.1  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  34.56 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  34.27 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 235 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 239 aa  78.2  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  32.11 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431523 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
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NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 216 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 234 aa  72  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 234 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  26.94 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  27.93 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0788  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.285865  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  28 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
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NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
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NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
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NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
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NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  24.4 
 
 		 184 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
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NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  27.41 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
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NC_010676  Bphyt_4167  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570017  normal  0.0286956 
 
 
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NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  28.57 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0647727 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_1611  regulatory protein TetR  22.22 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.993172  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
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NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
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NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
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NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  26.19 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
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