208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5603 on replicon NC_009341
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  457  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  38.31 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 211 aa  99  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4409  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 220 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.182996  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1611  regulatory protein TetR  37.23 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.993172  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 222 aa  92.4  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4103  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4723  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 230 aa  90.1  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4615  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6821  transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 191 aa  87.4  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4058  TetR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 218 aa  86.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3274  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4026  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.62673  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4769  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 206 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  33.69 
 
 		 207 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02070  transcriptional regulator, tetR family  34.04 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00920  transcriptional regulator, tetR family  27.08 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  34.62 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 236 aa  72  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431523 
 
 
-
 
NC_003296  RS03880  putative transcription regulator protein  34.64 
 
 		 214 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.557481 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  28.43 
 
 		 201 aa  68.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  32.79 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4571  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.281671  normal  0.592331 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3499  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.553383  normal  0.3226 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  28.21 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4167  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570017  normal  0.0286956 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  30.29 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  34.45 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  33.12 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  27.75 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 192 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  28.99 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  30.87 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 191 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 184 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>