234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_02070 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_02070  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 218 aa  424  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4615  TetR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4723  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3499  transcriptional regulator, TetR family  45.41 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.553383  normal  0.3226 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4571  transcriptional regulator, TetR family  45.41 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.281671  normal  0.592331 
 
 
-
 
NC_003296  RS03880  putative transcription regulator protein  50 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.557481 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4058  TetR family transcriptional regulator  47.34 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4103  TetR family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4769  TetR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 219 aa  141  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4026  TetR family transcriptional regulator  47.8 
 
 		 234 aa  134  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.62673  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1611  regulatory protein TetR  43.26 
 
 		 222 aa  131  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.993172  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 216 aa  131  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 191 aa  129  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4409  transcriptional regulator, TetR family  42.44 
 
 		 220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.182996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6821  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3274  transcriptional regulator, TetR family  41.63 
 
 		 233 aa  118  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00920  transcriptional regulator, tetR family  38.98 
 
 		 240 aa  111  9e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 224 aa  87.4  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 217 aa  85.9  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  35.1 
 
 		 203 aa  85.1  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 202 aa  84.7  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  35.5 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  37.84 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  34.74 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  34.07 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
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NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
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NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  34.66 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
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NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  38.06 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_2424  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351018  normal  0.169274 
 
 
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NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
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NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 205 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 181 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 205 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431523 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  34.3 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4167  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570017  normal  0.0286956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6348  transcriptional regulator, TetR family  44.87 
 
 		 400 aa  62.4  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00107036  hitchhiker  0.00103053 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 194 aa  62  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 204 aa  62  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  29.38 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4916  hypothetical protein  36.11 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195255  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  41.05 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
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NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
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NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
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