More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1369 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
208 aa  440  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  64 
 
 
201 aa  281  5.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  55.44 
 
 
204 aa  237  9e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
200 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 
203 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 
204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  36.09 
 
 
199 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
222 aa  106  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 
212 aa  105  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
204 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 
207 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  32.8 
 
 
206 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  32.55 
 
 
206 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 
202 aa  95.5  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 
196 aa  94.7  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
192 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
184 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  32.51 
 
 
202 aa  92.8  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 
196 aa  92.8  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 
184 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 
184 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
204 aa  90.5  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 
201 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 
211 aa  89.4  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 
181 aa  88.6  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
240 aa  88.2  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
186 aa  87.4  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
237 aa  86.7  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 
193 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
150 aa  85.5  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 
206 aa  85.5  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 
236 aa  85.5  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
217 aa  84.7  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 
236 aa  84.7  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  27.17 
 
 
224 aa  84.7  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 
195 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 
239 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  38.05 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
217 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
217 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  40.19 
 
 
194 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  31.82 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  31.58 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
202 aa  77.8  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  39.05 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4167  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570017  normal  0.0286956 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.431523 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  34.07 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 
203 aa  74.7  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  30.11 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  30.12 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  26.13 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  34.91 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 
199 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009953  Sare_0788  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.285865  hitchhiker  0.00465255 
 
 
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NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  23.28 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0292147 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal 
 
 
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NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  29.87 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_6137  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 
196 aa  65.1  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.780623 
 
 
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NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 
200 aa  64.7  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal 
 
 
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