More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6011 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 203 aa  421  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  42.36 
 
 		 204 aa  192  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 200 aa  169  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  44.38 
 
 		 202 aa  167  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 248 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  47.32 
 
 		 307 aa  121  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  47.32 
 
 		 333 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 203 aa  111  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 219 aa  101  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 207 aa  99.8  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 208 aa  95.9  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 203 aa  94.7  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 215 aa  92  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 230 aa  91.3  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 197 aa  89  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  30.85 
 
 		 199 aa  88.2  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  32.89 
 
 		 221 aa  84.7  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  27.09 
 
 		 203 aa  84.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  26.11 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 224 aa  81.3  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 222 aa  81.3  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  28.81 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1838  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  26.07 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 195 aa  77.8  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  28.74 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5095  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.666558  normal  0.638711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
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NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3274  transcriptional regulator, TetR family  24.76 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4491  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  35.83 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3554  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.725934  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0670  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3546  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  34.82 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  27.87 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0170  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
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NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0174  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
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NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_0167  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.266146 
 
 
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NC_008577  Shewana3_0172  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.194351  normal  1 
 
 
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NC_009052  Sbal_4185  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  23.86 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011663  Sbal223_4083  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  26.25 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_0172  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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